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三尾神社(みお・じんじゃ)は、滋賀県大津市園城寺町にある神社。祭神は伊弉諾尊。 園城寺一帯の地主神とされ、同寺の鎮守である。高島水尾神社との関係が指摘されている。県社。
南院の中心だった。
上ノ三尾(琴尾谷)にあった。明治9年に現在地に遷座。 明治43年、県社昇格。
園城寺境内に三尾影向石がある。