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雲居寺(うんごじ、くもいでら)は、京都府京都市東山区にあった桓武天皇菩提寺の天台宗寺院。廃絶。(参考:同名寺院雲居寺)
承和4年(837)、菅野真道が桓武天皇の菩提を弔うために創建したという。金色八丈の阿弥陀如来像があったという。現在の高台寺周辺にあった。