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神護寺(じんごじ)は、京都府京都市右京区高雄にある真言宗寺院。和気氏の氏寺。高雄山寺と神願寺が合併して成立。最澄も空海も帰国直後にここで修法を行っており、日本密教の発祥地ともいえる。和気氏の氏寺。鎮守は平岡八幡宮。和気清麻呂墓と護王神社の元宮に当たる護王善神社がある。
古代には神護寺別当が置かれた。