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本妙寺(ほんみょうじ)は新潟県長岡市日赤町にある日蓮宗寺院。日陣門流の拠点で、法華宗陣門流の准聖跡。山号は長秋山。 (参考:同名寺院本妙寺)
1607年(慶長12年)、本成寺の僧日楽が椿沢に開いた草庵が起源。 のち上寺町に移転。1660年(万治3年)、現在地に移転。戊辰戦争の兵火で焼失。1902年(明治35年)再建。 (日本歴史地名大系)