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覚意三昧院は、滋賀県大津市の比叡山延暦寺の東塔地区南谷にあった仏堂。本尊は十一面観音。最澄の構想した十六院の一つで、四種三昧院の一つ。東塔法華堂の北にあった。非行非坐三昧院、非行非坐三昧堂、随自意三昧堂とも。
最澄の生前には実現せず。貞観年間（859-877）、清和天皇の御願寺として創建。1213年(建保1年)に倒壊。以後、再興されなかった。（日本歴史地名大系）
